Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK2

SNRNP27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP27Q8WVK2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRNP27Q8WVK2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRNP27Q8WVK2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRNP27Q8WVK2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRNP27Q8WVK2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRNP27Q8WVK2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRNP27Q8WVK2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRNP27Q8WVK2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRNP27Q8WVK2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRNP27Q8WVK2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRNP27Q8WVK2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP27Q8WVK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNRNP27Q8WVK2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNRNP27Q8WVK2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP27Q8WVK2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNRNP27Q8WVK2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNRNP27Q8WVK2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNRNP27Q8WVK2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNRNP27Q8WVK2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNRNP27Q8WVK2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNRNP27Q8WVK2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SNRNP27Q8WVK2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNRNP27Q8WVK2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNRNP27Q8WVK2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNRNP27Q8WVK2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNRNP27Q8WVK2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNRNP27Q8WVK2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNRNP27Q8WVK2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNRNP27Q8WVK2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNRNP27Q8WVK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRNP27Q8WVK2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNRNP27Q8WVK2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNRNP27Q8WVK2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNRNP27Q8WVK2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SNRNP27Q8WVK2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SNRNP27Q8WVK2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SNRNP27Q8WVK2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SNRNP27Q8WVK2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms