Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV60

PTCD2, Pentatricopeptide repeat-containing protein 2, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCD2Q8WV60 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCD2Q8WV60 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTCD2Q8WV60 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTCD2Q8WV60 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTCD2Q8WV60 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCD2Q8WV60 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTCD2Q8WV60 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTCD2Q8WV60 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTCD2Q8WV60 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTCD2Q8WV60 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTCD2Q8WV60 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCD2Q8WV60 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCD2Q8WV60 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCD2Q8WV60 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTCD2Q8WV60 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTCD2Q8WV60 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCD2Q8WV60 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCD2Q8WV60 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTCD2Q8WV60 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTCD2Q8WV60 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCD2Q8WV60 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTCD2Q8WV60 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTCD2Q8WV60 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTCD2Q8WV60 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTCD2Q8WV60 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTCD2Q8WV60 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCD2Q8WV60 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTCD2Q8WV60 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTCD2Q8WV60 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms