Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PNPLA1Q8N8W4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PNPLA1Q8N8W4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PNPLA1Q8N8W4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNPLA1Q8N8W4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PNPLA1Q8N8W4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PNPLA1Q8N8W4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PNPLA1Q8N8W4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNPLA1Q8N8W4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PNPLA1Q8N8W4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PNPLA1Q8N8W4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PNPLA1Q8N8W4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PNPLA1Q8N8W4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PNPLA1Q8N8W4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNPLA1Q8N8W4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PNPLA1Q8N8W4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PNPLA1Q8N8W4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PNPLA1Q8N8W4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PNPLA1Q8N8W4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PNPLA1Q8N8W4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PNPLA1Q8N8W4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PNPLA1Q8N8W4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PNPLA1Q8N8W4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PNPLA1Q8N8W4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNPLA1Q8N8W4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PNPLA1Q8N8W4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PNPLA1Q8N8W4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PNPLA1Q8N8W4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PNPLA1Q8N8W4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PNPLA1Q8N8W4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PNPLA1Q8N8W4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PNPLA1Q8N8W4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PNPLA1Q8N8W4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PNPLA1Q8N8W4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PNPLA1Q8N8W4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PNPLA1Q8N8W4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PNPLA1Q8N8W4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNPLA1Q8N8W4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PNPLA1Q8N8W4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PNPLA1Q8N8W4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PNPLA1Q8N8W4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PNPLA1Q8N8W4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PNPLA1Q8N8W4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PNPLA1Q8N8W4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA1Q8N8W4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PNPLA1Q8N8W4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PNPLA1Q8N8W4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PNPLA1Q8N8W4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNPLA1Q8N8W4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms