Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC22A16Q86VW1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC22A16Q86VW1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC22A16Q86VW1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC22A16Q86VW1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC22A16Q86VW1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC22A16Q86VW1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC22A16Q86VW1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC22A16Q86VW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC22A16Q86VW1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC22A16Q86VW1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC22A16Q86VW1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC22A16Q86VW1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC22A16Q86VW1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC22A16Q86VW1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC22A16Q86VW1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC22A16Q86VW1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC22A16Q86VW1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC22A16Q86VW1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC22A16Q86VW1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC22A16Q86VW1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC22A16Q86VW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC22A16Q86VW1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC22A16Q86VW1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC22A16Q86VW1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A16Q86VW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC22A16Q86VW1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC22A16Q86VW1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC22A16Q86VW1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC22A16Q86VW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC22A16Q86VW1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC22A16Q86VW1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC22A16Q86VW1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC22A16Q86VW1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC22A16Q86VW1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC22A16Q86VW1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC22A16Q86VW1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC22A16Q86VW1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC22A16Q86VW1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC22A16Q86VW1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC22A16Q86VW1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC22A16Q86VW1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC22A16Q86VW1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC22A16Q86VW1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms