Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ALYREFQ86V81 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
ALYREFQ86V81 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ALYREFQ86V81 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALYREFQ86V81 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ALYREFQ86V81 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALYREFQ86V81 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ALYREFQ86V81 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ALYREFQ86V81 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ALYREFQ86V81 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ALYREFQ86V81 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ALYREFQ86V81 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ALYREFQ86V81 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ALYREFQ86V81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ALYREFQ86V81 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ALYREFQ86V81 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALYREFQ86V81 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ALYREFQ86V81 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ALYREFQ86V81 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ALYREFQ86V81 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ALYREFQ86V81 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ALYREFQ86V81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALYREFQ86V81 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ALYREFQ86V81 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALYREFQ86V81 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ALYREFQ86V81 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ALYREFQ86V81 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ALYREFQ86V81 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ALYREFQ86V81 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ALYREFQ86V81 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALYREFQ86V81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ALYREFQ86V81 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALYREFQ86V81 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALYREFQ86V81 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALYREFQ86V81 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALYREFQ86V81 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALYREFQ86V81 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALYREFQ86V81 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALYREFQ86V81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALYREFQ86V81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALYREFQ86V81 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ALYREFQ86V81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ALYREFQ86V81 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALYREFQ86V81 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ALYREFQ86V81 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALYREFQ86V81 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ALYREFQ86V81 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ALYREFQ86V81 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ALYREFQ86V81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ALYREFQ86V81 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALYREFQ86V81 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ALYREFQ86V81 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ALYREFQ86V81 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ALYREFQ86V81 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ALYREFQ86V81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALYREFQ86V81 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ALYREFQ86V81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ALYREFQ86V81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ALYREFQ86V81 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ALYREFQ86V81 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALYREFQ86V81 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms