Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST4

LCNL1, Lipocalin-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCNL1Q6ZST4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCNL1Q6ZST4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCNL1Q6ZST4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LCNL1Q6ZST4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LCNL1Q6ZST4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LCNL1Q6ZST4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCNL1Q6ZST4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LCNL1Q6ZST4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCNL1Q6ZST4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LCNL1Q6ZST4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LCNL1Q6ZST4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LCNL1Q6ZST4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LCNL1Q6ZST4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LCNL1Q6ZST4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCNL1Q6ZST4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCNL1Q6ZST4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCNL1Q6ZST4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LCNL1Q6ZST4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCNL1Q6ZST4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCNL1Q6ZST4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCNL1Q6ZST4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCNL1Q6ZST4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms