Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASC2Q6XLA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASC2Q6XLA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CASC2Q6XLA1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CASC2Q6XLA1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASC2Q6XLA1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CASC2Q6XLA1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASC2Q6XLA1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CASC2Q6XLA1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CASC2Q6XLA1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASC2Q6XLA1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASC2Q6XLA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CASC2Q6XLA1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASC2Q6XLA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASC2Q6XLA1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms