Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA3EQ6PEY2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA3EQ6PEY2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBA3EQ6PEY2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TUBA3EQ6PEY2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBA3EQ6PEY2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBA3EQ6PEY2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBA3EQ6PEY2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBA3EQ6PEY2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBA3EQ6PEY2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA3EQ6PEY2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBA3EQ6PEY2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBA3EQ6PEY2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBA3EQ6PEY2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TUBA3EQ6PEY2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TUBA3EQ6PEY2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TUBA3EQ6PEY2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TUBA3EQ6PEY2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TUBA3EQ6PEY2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3EQ6PEY2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TUBA3EQ6PEY2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TUBA3EQ6PEY2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TUBA3EQ6PEY2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TUBA3EQ6PEY2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TUBA3EQ6PEY2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TUBA3EQ6PEY2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TUBA3EQ6PEY2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBA3EQ6PEY2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms