Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SFT2D3Q587I9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SFT2D3Q587I9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SFT2D3Q587I9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SFT2D3Q587I9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SFT2D3Q587I9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SFT2D3Q587I9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SFT2D3Q587I9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SFT2D3Q587I9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SFT2D3Q587I9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SFT2D3Q587I9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SFT2D3Q587I9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SFT2D3Q587I9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SFT2D3Q587I9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SFT2D3Q587I9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SFT2D3Q587I9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFT2D3Q587I9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SFT2D3Q587I9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SFT2D3Q587I9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SFT2D3Q587I9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SFT2D3Q587I9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SFT2D3Q587I9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SFT2D3Q587I9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SFT2D3Q587I9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFT2D3Q587I9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SFT2D3Q587I9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SFT2D3Q587I9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SFT2D3Q587I9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SFT2D3Q587I9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SFT2D3Q587I9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms