Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL68

PROSER3, Proline and serine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROSER3Q2NL68 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PROSER3Q2NL68 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PROSER3Q2NL68 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PROSER3Q2NL68 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PROSER3Q2NL68 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PROSER3Q2NL68 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
PROSER3Q2NL68 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PROSER3Q2NL68 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PROSER3Q2NL68 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PROSER3Q2NL68 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PROSER3Q2NL68 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PROSER3Q2NL68 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PROSER3Q2NL68 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PROSER3Q2NL68 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
PROSER3Q2NL68 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
PROSER3Q2NL68 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
PROSER3Q2NL68 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PROSER3Q2NL68 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
PROSER3Q2NL68 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
PROSER3Q2NL68 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PROSER3Q2NL68 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PROSER3Q2NL68 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
PROSER3Q2NL68 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PROSER3Q2NL68 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
PROSER3Q2NL68 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PROSER3Q2NL68 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PROSER3Q2NL68 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PROSER3Q2NL68 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PROSER3Q2NL68 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PROSER3Q2NL68 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PROSER3Q2NL68 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PROSER3Q2NL68 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PROSER3Q2NL68 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PROSER3Q2NL68 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PROSER3Q2NL68 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PROSER3Q2NL68 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PROSER3Q2NL68 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PROSER3Q2NL68 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PROSER3Q2NL68 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PROSER3Q2NL68 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PROSER3Q2NL68 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PROSER3Q2NL68 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PROSER3Q2NL68 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PROSER3Q2NL68 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PROSER3Q2NL68 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PROSER3Q2NL68 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PROSER3Q2NL68 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PROSER3Q2NL68 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PROSER3Q2NL68 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
PROSER3Q2NL68 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PROSER3Q2NL68 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PROSER3Q2NL68 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PROSER3Q2NL68 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PROSER3Q2NL68 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PROSER3Q2NL68 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PROSER3Q2NL68 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PROSER3Q2NL68 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PROSER3Q2NL68 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PROSER3Q2NL68 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PROSER3Q2NL68 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PROSER3Q2NL68 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PROSER3Q2NL68 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PROSER3Q2NL68 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PROSER3Q2NL68 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms