Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SWI5Q1ZZU3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SWI5Q1ZZU3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWI5Q1ZZU3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWI5Q1ZZU3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWI5Q1ZZU3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWI5Q1ZZU3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SWI5Q1ZZU3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SWI5Q1ZZU3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWI5Q1ZZU3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWI5Q1ZZU3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWI5Q1ZZU3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SWI5Q1ZZU3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SWI5Q1ZZU3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWI5Q1ZZU3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWI5Q1ZZU3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWI5Q1ZZU3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWI5Q1ZZU3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SWI5Q1ZZU3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SWI5Q1ZZU3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWI5Q1ZZU3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWI5Q1ZZU3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SWI5Q1ZZU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SWI5Q1ZZU3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SWI5Q1ZZU3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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