Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LTC4SQ16873 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LTC4SQ16873 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LTC4SQ16873 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LTC4SQ16873 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTC4SQ16873 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LTC4SQ16873 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LTC4SQ16873 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LTC4SQ16873 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LTC4SQ16873 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LTC4SQ16873 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LTC4SQ16873 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LTC4SQ16873 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTC4SQ16873 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LTC4SQ16873 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LTC4SQ16873 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LTC4SQ16873 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTC4SQ16873 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTC4SQ16873 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTC4SQ16873 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTC4SQ16873 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTC4SQ16873 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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