Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPN21Q16825 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PTPN21Q16825 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPN21Q16825 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
PTPN21Q16825 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPN21Q16825 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN21Q16825 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN21Q16825 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPN21Q16825 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN21Q16825 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN21Q16825 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTPN21Q16825 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTPN21Q16825 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTPN21Q16825 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PTPN21Q16825 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPN21Q16825 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
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