Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NREPQ16612 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NREPQ16612 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NREPQ16612 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NREPQ16612 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NREPQ16612 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NREPQ16612 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NREPQ16612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NREPQ16612 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NREPQ16612 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NREPQ16612 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NREPQ16612 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NREPQ16612 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NREPQ16612 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NREPQ16612 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NREPQ16612 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NREPQ16612 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NREPQ16612 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NREPQ16612 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NREPQ16612 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NREPQ16612 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NREPQ16612 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NREPQ16612 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NREPQ16612 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NREPQ16612 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NREPQ16612 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NREPQ16612 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NREPQ16612 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NREPQ16612 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NREPQ16612 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NREPQ16612 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NREPQ16612 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NREPQ16612 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NREPQ16612 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NREPQ16612 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NREPQ16612 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NREPQ16612 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NREPQ16612 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NREPQ16612 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NREPQ16612 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NREPQ16612 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NREPQ16612 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NREPQ16612 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NREPQ16612 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NREPQ16612 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NREPQ16612 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NREPQ16612 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NREPQ16612 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NREPQ16612 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NREPQ16612 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NREPQ16612 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NREPQ16612 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NREPQ16612 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NREPQ16612 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NREPQ16612 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NREPQ16612 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NREPQ16612 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NREPQ16612 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NREPQ16612 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NREPQ16612 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NREPQ16612 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NREPQ16612 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NREPQ16612 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NREPQ16612 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NREPQ16612 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NREPQ16612 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NREPQ16612 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NREPQ16612 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NREPQ16612 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NREPQ16612 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NREPQ16612 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NREPQ16612 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NREPQ16612 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NREPQ16612 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NREPQ16612 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NREPQ16612 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NREPQ16612 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NREPQ16612 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NREPQ16612 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NREPQ16612 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NREPQ16612 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NREPQ16612 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NREPQ16612 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NREPQ16612 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NREPQ16612 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NREPQ16612 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NREPQ16612 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NREPQ16612 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NREPQ16612 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NREPQ16612 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NREPQ16612 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NREPQ16612 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NREPQ16612 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NREPQ16612 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NREPQ16612 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NREPQ16612 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NREPQ16612 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NREPQ16612 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NREPQ16612 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NREPQ16612 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms