Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAB35Q15286 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB35Q15286 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB35Q15286 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB35Q15286 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB35Q15286 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB35Q15286 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAB35Q15286 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB35Q15286 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB35Q15286 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB35Q15286 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB35Q15286 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB35Q15286 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB35Q15286 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB35Q15286 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB35Q15286 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB35Q15286 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB35Q15286 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB35Q15286 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB35Q15286 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB35Q15286 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB35Q15286 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB35Q15286 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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