Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PLCB3Q01970 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PLCB3Q01970 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PLCB3Q01970 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PLCB3Q01970 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLCB3Q01970 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLCB3Q01970 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PLCB3Q01970 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PLCB3Q01970 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PLCB3Q01970 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PLCB3Q01970 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PLCB3Q01970 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PLCB3Q01970 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PLCB3Q01970 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PLCB3Q01970 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PLCB3Q01970 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PLCB3Q01970 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PLCB3Q01970 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PLCB3Q01970 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PLCB3Q01970 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PLCB3Q01970 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PLCB3Q01970 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PLCB3Q01970 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PLCB3Q01970 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PLCB3Q01970 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLCB3Q01970 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PLCB3Q01970 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLCB3Q01970 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLCB3Q01970 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLCB3Q01970 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PLCB3Q01970 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLCB3Q01970 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PLCB3Q01970 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PLCB3Q01970 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLCB3Q01970 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLCB3Q01970 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PLCB3Q01970 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLCB3Q01970 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLCB3Q01970 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PLCB3Q01970 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PLCB3Q01970 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PLCB3Q01970 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PLCB3Q01970 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PLCB3Q01970 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLCB3Q01970 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PLCB3Q01970 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PLCB3Q01970 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
PLCB3Q01970 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PLCB3Q01970 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PLCB3Q01970 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PLCB3Q01970 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms