Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA52P62987 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBA52P62987 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBA52P62987 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UBA52P62987 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBA52P62987 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBA52P62987 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBA52P62987 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA52P62987 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBA52P62987 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA52P62987 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UBA52P62987 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA52P62987 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBA52P62987 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBA52P62987 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBA52P62987 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBA52P62987 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA52P62987 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA52P62987 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBA52P62987 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA52P62987 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBA52P62987 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA52P62987 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBA52P62987 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBA52P62987 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBA52P62987 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBA52P62987 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA52P62987 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBA52P62987 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBA52P62987 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA52P62987 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA52P62987 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA52P62987 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBA52P62987 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA52P62987 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBA52P62987 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBA52P62987 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBA52P62987 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBA52P62987 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA52P62987 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA52P62987 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA52P62987 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBA52P62987 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA52P62987 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA52P62987 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBA52P62987 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBA52P62987 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBA52P62987 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA52P62987 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA52P62987 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBA52P62987 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBA52P62987 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA52P62987 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA52P62987 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBA52P62987 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBA52P62987 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBA52P62987 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA52P62987 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBA52P62987 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA52P62987 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA52P62987 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBA52P62987 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA52P62987 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
UBA52P62987 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA52P62987 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
UBA52P62987 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA52P62987 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
UBA52P62987 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA52P62987 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA52P62987 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA52P62987 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
UBA52P62987 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
UBA52P62987 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA52P62987 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA52P62987 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
UBA52P62987 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA52P62987 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
UBA52P62987 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA52P62987 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA52P62987 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UBA52P62987 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UBA52P62987 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA52P62987 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA52P62987 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UBA52P62987 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBA52P62987 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBA52P62987 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBA52P62987 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBA52P62987 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBA52P62987 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBA52P62987 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA52P62987 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA52P62987 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBA52P62987 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBA52P62987 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms