Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLDN20P56880 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN20P56880 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN20P56880 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLDN20P56880 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLDN20P56880 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN20P56880 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN20P56880 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN20P56880 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN20P56880 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN20P56880 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN20P56880 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN20P56880 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN20P56880 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN20P56880 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN20P56880 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN20P56880 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CLDN20P56880 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN20P56880 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN20P56880 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN20P56880 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLDN20P56880 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN20P56880 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN20P56880 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN20P56880 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN20P56880 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN20P56880 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN20P56880 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN20P56880 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN20P56880 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN20P56880 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN20P56880 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms