Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CLDN17P56750 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CLDN17P56750 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLDN17P56750 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLDN17P56750 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLDN17P56750 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN17P56750 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN17P56750 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN17P56750 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN17P56750 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN17P56750 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN17P56750 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN17P56750 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN17P56750 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN17P56750 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN17P56750 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN17P56750 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN17P56750 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN17P56750 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN17P56750 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN17P56750 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLDN17P56750 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN17P56750 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN17P56750 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN17P56750 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN17P56750 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN17P56750 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDN17P56750 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN17P56750 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN17P56750 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN17P56750 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN17P56750 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.1 ms