Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CSE1LP55060 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CSE1LP55060 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSE1LP55060 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSE1LP55060 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CSE1LP55060 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CSE1LP55060 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CSE1LP55060 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CSE1LP55060 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CSE1LP55060 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CSE1LP55060 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CSE1LP55060 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CSE1LP55060 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CSE1LP55060 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CSE1LP55060 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CSE1LP55060 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CSE1LP55060 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CSE1LP55060 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CSE1LP55060 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CSE1LP55060 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSE1LP55060 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSE1LP55060 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSE1LP55060 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSE1LP55060 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSE1LP55060 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSE1LP55060 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSE1LP55060 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSE1LP55060 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSE1LP55060 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSE1LP55060 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSE1LP55060 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSE1LP55060 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSE1LP55060 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSE1LP55060 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CSE1LP55060 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CSE1LP55060 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CSE1LP55060 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CSE1LP55060 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms