Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NRLP54845 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NRLP54845 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NRLP54845 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRLP54845 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRLP54845 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NRLP54845 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRLP54845 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NRLP54845 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRLP54845 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NRLP54845 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NRLP54845 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NRLP54845 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NRLP54845 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NRLP54845 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NRLP54845 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NRLP54845 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NRLP54845 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NRLP54845 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRLP54845 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NRLP54845 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NRLP54845 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRLP54845 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRLP54845 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRLP54845 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NRLP54845 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRLP54845 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NRLP54845 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NRLP54845 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRLP54845 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NRLP54845 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NRLP54845 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRLP54845 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NRLP54845 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NRLP54845 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRLP54845 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NRLP54845 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NRLP54845 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NRLP54845 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRLP54845 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRLP54845 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NRLP54845 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRLP54845 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRLP54845 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRLP54845 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NRLP54845 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NRLP54845 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NRLP54845 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NRLP54845 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NRLP54845 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NRLP54845 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NRLP54845 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NRLP54845 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NRLP54845 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NRLP54845 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRLP54845 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRLP54845 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NRLP54845 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRLP54845 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NRLP54845 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRLP54845 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NRLP54845 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRLP54845 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NRLP54845 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRLP54845 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NRLP54845 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NRLP54845 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NRLP54845 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NRLP54845 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NRLP54845 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NRLP54845 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRLP54845 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NRLP54845 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NRLP54845 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NRLP54845 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NRLP54845 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NRLP54845 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NRLP54845 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRLP54845 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NRLP54845 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NRLP54845 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NRLP54845 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NRLP54845 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRLP54845 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRLP54845 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NRLP54845 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRLP54845 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NRLP54845 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NRLP54845 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NRLP54845 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRLP54845 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NRLP54845 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRLP54845 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NRLP54845 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NRLP54845 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
NRLP54845 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NRLP54845 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NRLP54845 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NRLP54845 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NRLP54845 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms