Protein–RNA interactions for Protein: P53673

CRYBA4, Beta-crystallin A4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBA4P53673 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRYBA4P53673 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRYBA4P53673 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRYBA4P53673 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRYBA4P53673 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRYBA4P53673 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRYBA4P53673 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBA4P53673 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBA4P53673 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRYBA4P53673 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CRYBA4P53673 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CRYBA4P53673 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CRYBA4P53673 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRYBA4P53673 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRYBA4P53673 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CRYBA4P53673 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CRYBA4P53673 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CRYBA4P53673 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CRYBA4P53673 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBA4P53673 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CRYBA4P53673 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRYBA4P53673 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBA4P53673 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRYBA4P53673 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRYBA4P53673 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRYBA4P53673 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CRYBA4P53673 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRYBA4P53673 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRYBA4P53673 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CRYBA4P53673 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRYBA4P53673 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms