Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN1P51911 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN1P51911 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNN1P51911 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNN1P51911 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN1P51911 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNN1P51911 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNN1P51911 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNN1P51911 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNN1P51911 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNN1P51911 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN1P51911 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN1P51911 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN1P51911 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN1P51911 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNN1P51911 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNN1P51911 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN1P51911 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN1P51911 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN1P51911 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN1P51911 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNN1P51911 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN1P51911 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN1P51911 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN1P51911 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN1P51911 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN1P51911 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN1P51911 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN1P51911 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN1P51911 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN1P51911 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN1P51911 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNN1P51911 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN1P51911 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN1P51911 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN1P51911 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNN1P51911 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN1P51911 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN1P51911 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNN1P51911 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN1P51911 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNN1P51911 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNN1P51911 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNN1P51911 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN1P51911 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN1P51911 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNN1P51911 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNN1P51911 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN1P51911 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNN1P51911 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNN1P51911 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN1P51911 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNN1P51911 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNN1P51911 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNN1P51911 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNN1P51911 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNN1P51911 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNN1P51911 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN1P51911 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNN1P51911 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN1P51911 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN1P51911 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNN1P51911 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNN1P51911 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNN1P51911 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN1P51911 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN1P51911 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNN1P51911 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN1P51911 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN1P51911 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN1P51911 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNN1P51911 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNN1P51911 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNN1P51911 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNN1P51911 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN1P51911 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNN1P51911 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CNN1P51911 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNN1P51911 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNN1P51911 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN1P51911 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNN1P51911 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CNN1P51911 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN1P51911 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN1P51911 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CNN1P51911 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNN1P51911 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNN1P51911 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CNN1P51911 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CNN1P51911 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNN1P51911 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNN1P51911 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNN1P51911 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN1P51911 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNN1P51911 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN1P51911 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNN1P51911 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNN1P51911 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNN1P51911 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CNN1P51911 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms