Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NMUP48645 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NMUP48645 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMUP48645 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMUP48645 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMUP48645 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMUP48645 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMUP48645 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMUP48645 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMUP48645 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NMUP48645 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMUP48645 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMUP48645 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMUP48645 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMUP48645 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMUP48645 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMUP48645 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMUP48645 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMUP48645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMUP48645 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMUP48645 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMUP48645 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMUP48645 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMUP48645 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMUP48645 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMUP48645 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMUP48645 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NMUP48645 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NMUP48645 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMUP48645 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMUP48645 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMUP48645 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NMUP48645 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMUP48645 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NMUP48645 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMUP48645 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NMUP48645 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NMUP48645 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMUP48645 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NMUP48645 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMUP48645 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMUP48645 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NMUP48645 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMUP48645 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NMUP48645 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NMUP48645 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMUP48645 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NMUP48645 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMUP48645 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NMUP48645 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NMUP48645 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMUP48645 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMUP48645 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NMUP48645 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NMUP48645 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMUP48645 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NMUP48645 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NMUP48645 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NMUP48645 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMUP48645 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NMUP48645 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NMUP48645 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMUP48645 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NMUP48645 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NMUP48645 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NMUP48645 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NMUP48645 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NMUP48645 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMUP48645 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NMUP48645 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NMUP48645 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NMUP48645 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NMUP48645 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMUP48645 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMUP48645 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMUP48645 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NMUP48645 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMUP48645 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMUP48645 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMUP48645 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NMUP48645 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NMUP48645 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMUP48645 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMUP48645 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NMUP48645 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NMUP48645 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMUP48645 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMUP48645 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMUP48645 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMUP48645 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NMUP48645 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NMUP48645 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMUP48645 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NMUP48645 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NMUP48645 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMUP48645 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMUP48645 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NMUP48645 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NMUP48645 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NMUP48645 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms