Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XCR1P46094 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XCR1P46094 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XCR1P46094 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XCR1P46094 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XCR1P46094 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XCR1P46094 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XCR1P46094 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XCR1P46094 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XCR1P46094 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XCR1P46094 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XCR1P46094 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XCR1P46094 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XCR1P46094 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XCR1P46094 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XCR1P46094 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XCR1P46094 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XCR1P46094 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XCR1P46094 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
XCR1P46094 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XCR1P46094 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XCR1P46094 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XCR1P46094 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XCR1P46094 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XCR1P46094 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XCR1P46094 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XCR1P46094 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XCR1P46094 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XCR1P46094 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
XCR1P46094 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
XCR1P46094 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XCR1P46094 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XCR1P46094 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
XCR1P46094 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
XCR1P46094 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XCR1P46094 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XCR1P46094 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
XCR1P46094 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XCR1P46094 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
XCR1P46094 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XCR1P46094 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XCR1P46094 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
XCR1P46094 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XCR1P46094 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XCR1P46094 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
XCR1P46094 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
XCR1P46094 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
XCR1P46094 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
XCR1P46094 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XCR1P46094 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
XCR1P46094 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XCR1P46094 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
XCR1P46094 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XCR1P46094 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
XCR1P46094 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
XCR1P46094 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
XCR1P46094 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XCR1P46094 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XCR1P46094 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XCR1P46094 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
XCR1P46094 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XCR1P46094 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XCR1P46094 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
XCR1P46094 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
XCR1P46094 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XCR1P46094 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XCR1P46094 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XCR1P46094 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XCR1P46094 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XCR1P46094 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
XCR1P46094 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XCR1P46094 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XCR1P46094 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
XCR1P46094 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
XCR1P46094 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
XCR1P46094 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XCR1P46094 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
XCR1P46094 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XCR1P46094 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XCR1P46094 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
XCR1P46094 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XCR1P46094 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XCR1P46094 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XCR1P46094 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XCR1P46094 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XCR1P46094 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XCR1P46094 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XCR1P46094 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XCR1P46094 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XCR1P46094 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XCR1P46094 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
XCR1P46094 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XCR1P46094 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XCR1P46094 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XCR1P46094 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XCR1P46094 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XCR1P46094 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
XCR1P46094 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XCR1P46094 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XCR1P46094 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms