Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
MYH11P35749 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYH11P35749 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
MYH11P35749 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
MYH11P35749 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MYH11P35749 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
MYH11P35749 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MYH11P35749 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
MYH11P35749 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MYH11P35749 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MYH11P35749 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYH11P35749 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYH11P35749 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH11P35749 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYH11P35749 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYH11P35749 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYH11P35749 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYH11P35749 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MYH11P35749 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
MYH11P35749 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
MYH11P35749 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYH11P35749 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYH11P35749 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYH11P35749 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYH11P35749 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYH11P35749 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYH11P35749 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYH11P35749 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYH11P35749 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
MYH11P35749 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
MYH11P35749 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.65
MYH11P35749 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYH11P35749 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
MYH11P35749 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYH11P35749 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYH11P35749 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYH11P35749 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
MYH11P35749 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYH11P35749 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
MYH11P35749 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYH11P35749 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
MYH11P35749 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
MYH11P35749 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
MYH11P35749 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
MYH11P35749 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MYH11P35749 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
MYH11P35749 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MYH11P35749 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MYH11P35749 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MYH11P35749 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
MYH11P35749 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYH11P35749 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYH11P35749 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MYH11P35749 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYH11P35749 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYH11P35749 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYH11P35749 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYH11P35749 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
MYH11P35749 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYH11P35749 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
MYH11P35749 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYH11P35749 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
MYH11P35749 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYH11P35749 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MYH11P35749 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYH11P35749 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYH11P35749 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYH11P35749 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYH11P35749 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
MYH11P35749 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYH11P35749 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
MYH11P35749 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH11P35749 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH11P35749 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYH11P35749 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH11P35749 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
MYH11P35749 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYH11P35749 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
MYH11P35749 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYH11P35749 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
MYH11P35749 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
MYH11P35749 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
MYH11P35749 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
MYH11P35749 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
MYH11P35749 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
MYH11P35749 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
MYH11P35749 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
MYH11P35749 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
MYH11P35749 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
MYH11P35749 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
MYH11P35749 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
MYH11P35749 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
MYH11P35749 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH11P35749 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH11P35749 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH11P35749 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
MYH11P35749 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
MYH11P35749 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
MYH11P35749 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
MYH11P35749 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms