Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHRNA3P32297 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHRNA3P32297 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHRNA3P32297 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHRNA3P32297 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHRNA3P32297 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHRNA3P32297 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHRNA3P32297 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHRNA3P32297 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CHRNA3P32297 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CHRNA3P32297 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CHRNA3P32297 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CHRNA3P32297 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CHRNA3P32297 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHRNA3P32297 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CHRNA3P32297 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHRNA3P32297 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHRNA3P32297 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA3P32297 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA3P32297 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHRNA3P32297 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHRNA3P32297 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHRNA3P32297 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHRNA3P32297 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHRNA3P32297 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHRNA3P32297 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CHRNA3P32297 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CHRNA3P32297 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CHRNA3P32297 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CHRNA3P32297 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHRNA3P32297 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHRNA3P32297 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms