Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MYH1P12882 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
MYH1P12882 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
MYH1P12882 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
MYH1P12882 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MYH1P12882 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
MYH1P12882 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
MYH1P12882 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
MYH1P12882 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
MYH1P12882 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
MYH1P12882 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
MYH1P12882 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYH1P12882 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
MYH1P12882 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
MYH1P12882 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYH1P12882 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MYH1P12882 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
MYH1P12882 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYH1P12882 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MYH1P12882 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
MYH1P12882 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
MYH1P12882 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
MYH1P12882 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH1P12882 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
MYH1P12882 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
MYH1P12882 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
MYH1P12882 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
MYH1P12882 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
MYH1P12882 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MYH1P12882 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH1P12882 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH1P12882 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MYH1P12882 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH1P12882 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
MYH1P12882 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
MYH1P12882 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYH1P12882 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
MYH1P12882 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MYH1P12882 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MYH1P12882 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH1P12882 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MYH1P12882 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MYH1P12882 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MYH1P12882 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYH1P12882 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
MYH1P12882 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYH1P12882 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
MYH1P12882 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MYH1P12882 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MYH1P12882 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MYH1P12882 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MYH1P12882 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH1P12882 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
MYH1P12882 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH1P12882 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH1P12882 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
MYH1P12882 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MYH1P12882 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MYH1P12882 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MYH1P12882 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MYH1P12882 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH1P12882 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH1P12882 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH1P12882 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH1P12882 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH1P12882 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MYH1P12882 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MYH1P12882 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MYH1P12882 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MYH1P12882 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
MYH1P12882 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MYH1P12882 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
MYH1P12882 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH1P12882 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MYH1P12882 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH1P12882 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
MYH1P12882 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH1P12882 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MYH1P12882 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
MYH1P12882 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
MYH1P12882 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
MYH1P12882 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
MYH1P12882 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MYH1P12882 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MYH1P12882 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
MYH1P12882 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH1P12882 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MYH1P12882 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH1P12882 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH1P12882 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH1P12882 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
MYH1P12882 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MYH1P12882 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MYH1P12882 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
MYH1P12882 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
MYH1P12882 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
MYH1P12882 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MYH1P12882 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYH1P12882 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MYH1P12882 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms