Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM6P0DI80 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM6P0DI80 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMIM6P0DI80 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMIM6P0DI80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMIM6P0DI80 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM6P0DI80 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM6P0DI80 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM6P0DI80 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM6P0DI80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM6P0DI80 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM6P0DI80 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM6P0DI80 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM6P0DI80 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SMIM6P0DI80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SMIM6P0DI80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM6P0DI80 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMIM6P0DI80 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMIM6P0DI80 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM6P0DI80 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMIM6P0DI80 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SMIM6P0DI80 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SMIM6P0DI80 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SMIM6P0DI80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMIM6P0DI80 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms