Protein–RNA interactions for Protein: P06312

IGKV4-1, Immunoglobulin kappa variable 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV4-1P06312 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
IGKV4-1P06312 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV4-1P06312 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
IGKV4-1P06312 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
IGKV4-1P06312 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
IGKV4-1P06312 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
IGKV4-1P06312 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IGKV4-1P06312 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IGKV4-1P06312 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGKV4-1P06312 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV4-1P06312 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IGKV4-1P06312 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
IGKV4-1P06312 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV4-1P06312 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IGKV4-1P06312 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
IGKV4-1P06312 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms