Protein–RNA interactions for Protein: P06307

CCK, Cholecystokinin, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKP06307 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKP06307 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCKP06307 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCKP06307 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKP06307 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCKP06307 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKP06307 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCKP06307 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCKP06307 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCKP06307 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCKP06307 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKP06307 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKP06307 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKP06307 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCKP06307 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKP06307 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKP06307 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCKP06307 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKP06307 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCKP06307 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCKP06307 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCKP06307 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKP06307 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKP06307 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCKP06307 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKP06307 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKP06307 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCKP06307 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKP06307 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCKP06307 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKP06307 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCKP06307 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKP06307 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCKP06307 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKP06307 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKP06307 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKP06307 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKP06307 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCKP06307 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCKP06307 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCKP06307 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKP06307 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCKP06307 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKP06307 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCKP06307 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCKP06307 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCKP06307 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKP06307 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCKP06307 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCKP06307 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCKP06307 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKP06307 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCKP06307 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKP06307 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCKP06307 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKP06307 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKP06307 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCKP06307 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKP06307 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCKP06307 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CCKP06307 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKP06307 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKP06307 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCKP06307 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCKP06307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCKP06307 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKP06307 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCKP06307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKP06307 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKP06307 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCKP06307 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKP06307 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCKP06307 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCKP06307 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKP06307 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKP06307 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKP06307 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKP06307 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKP06307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKP06307 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCKP06307 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCKP06307 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCKP06307 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCKP06307 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CCKP06307 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CCKP06307 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKP06307 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCKP06307 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKP06307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKP06307 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCKP06307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKP06307 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCKP06307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCKP06307 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCKP06307 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 435.9 ms