Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFDP00746 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFDP00746 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFDP00746 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFDP00746 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CFDP00746 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CFDP00746 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CFDP00746 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CFDP00746 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CFDP00746 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CFDP00746 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFDP00746 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFDP00746 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFDP00746 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFDP00746 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFDP00746 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFDP00746 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFDP00746 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFDP00746 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFDP00746 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFDP00746 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFDP00746 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFDP00746 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFDP00746 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFDP00746 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CFDP00746 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CFDP00746 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFDP00746 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CFDP00746 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFDP00746 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFDP00746 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFDP00746 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFDP00746 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFDP00746 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFDP00746 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFDP00746 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFDP00746 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFDP00746 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFDP00746 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CFDP00746 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CFDP00746 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFDP00746 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CFDP00746 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CFDP00746 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CFDP00746 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFDP00746 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CFDP00746 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CFDP00746 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CFDP00746 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CFDP00746 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CFDP00746 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CFDP00746 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CFDP00746 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFDP00746 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CFDP00746 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFDP00746 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFDP00746 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFDP00746 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFDP00746 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CFDP00746 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CFDP00746 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CFDP00746 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFDP00746 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CFDP00746 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFDP00746 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFDP00746 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFDP00746 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFDP00746 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFDP00746 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFDP00746 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFDP00746 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFDP00746 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFDP00746 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CFDP00746 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFDP00746 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CFDP00746 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CFDP00746 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CFDP00746 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFDP00746 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFDP00746 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CFDP00746 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFDP00746 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFDP00746 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFDP00746 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFDP00746 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFDP00746 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFDP00746 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFDP00746 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFDP00746 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFDP00746 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CFDP00746 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFDP00746 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CFDP00746 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFDP00746 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFDP00746 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFDP00746 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFDP00746 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFDP00746 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFDP00746 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFDP00746 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms