Protein–RNA interactions for Protein: O95858

TSPAN15, Tetraspanin-15, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN15O95858 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN15O95858 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN15O95858 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN15O95858 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSPAN15O95858 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSPAN15O95858 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN15O95858 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN15O95858 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSPAN15O95858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN15O95858 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN15O95858 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN15O95858 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN15O95858 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN15O95858 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN15O95858 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN15O95858 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSPAN15O95858 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TSPAN15O95858 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN15O95858 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms