Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRMUO75648 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRMUO75648 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMUO75648 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRMUO75648 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRMUO75648 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRMUO75648 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRMUO75648 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRMUO75648 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRMUO75648 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRMUO75648 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRMUO75648 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMUO75648 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRMUO75648 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRMUO75648 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMUO75648 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMUO75648 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMUO75648 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRMUO75648 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMUO75648 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRMUO75648 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRMUO75648 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMUO75648 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMUO75648 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRMUO75648 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMUO75648 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRMUO75648 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRMUO75648 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRMUO75648 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRMUO75648 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRMUO75648 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMUO75648 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMUO75648 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRMUO75648 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRMUO75648 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRMUO75648 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMUO75648 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMUO75648 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRMUO75648 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRMUO75648 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRMUO75648 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMUO75648 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRMUO75648 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMUO75648 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMUO75648 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRMUO75648 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMUO75648 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRMUO75648 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRMUO75648 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMUO75648 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMUO75648 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMUO75648 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMUO75648 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMUO75648 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMUO75648 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMUO75648 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMUO75648 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMUO75648 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMUO75648 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMUO75648 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMUO75648 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMUO75648 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMUO75648 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMUO75648 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMUO75648 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRMUO75648 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRMUO75648 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMUO75648 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRMUO75648 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRMUO75648 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRMUO75648 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRMUO75648 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMUO75648 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRMUO75648 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRMUO75648 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMUO75648 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRMUO75648 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMUO75648 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMUO75648 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRMUO75648 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRMUO75648 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMUO75648 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRMUO75648 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRMUO75648 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRMUO75648 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMUO75648 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRMUO75648 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMUO75648 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRMUO75648 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRMUO75648 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMUO75648 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMUO75648 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRMUO75648 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRMUO75648 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRMUO75648 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMUO75648 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRMUO75648 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRMUO75648 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRMUO75648 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRMUO75648 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms