Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SNX2O60749 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX2O60749 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SNX2O60749 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX2O60749 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX2O60749 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SNX2O60749 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SNX2O60749 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX2O60749 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SNX2O60749 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SNX2O60749 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SNX2O60749 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX2O60749 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SNX2O60749 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX2O60749 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX2O60749 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX2O60749 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX2O60749 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SNX2O60749 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX2O60749 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX2O60749 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX2O60749 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SNX2O60749 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SNX2O60749 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SNX2O60749 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SNX2O60749 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SNX2O60749 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SNX2O60749 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX2O60749 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SNX2O60749 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SNX2O60749 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX2O60749 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX2O60749 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX2O60749 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX2O60749 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX2O60749 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SNX2O60749 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SNX2O60749 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX2O60749 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX2O60749 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX2O60749 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SNX2O60749 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX2O60749 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX2O60749 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SNX2O60749 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SNX2O60749 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX2O60749 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SNX2O60749 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX2O60749 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX2O60749 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SNX2O60749 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SNX2O60749 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX2O60749 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SNX2O60749 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNX2O60749 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNX2O60749 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX2O60749 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNX2O60749 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNX2O60749 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX2O60749 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX2O60749 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNX2O60749 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX2O60749 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNX2O60749 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX2O60749 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNX2O60749 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX2O60749 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNX2O60749 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX2O60749 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNX2O60749 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNX2O60749 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX2O60749 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX2O60749 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX2O60749 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX2O60749 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX2O60749 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX2O60749 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX2O60749 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX2O60749 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX2O60749 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX2O60749 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX2O60749 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX2O60749 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX2O60749 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX2O60749 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX2O60749 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX2O60749 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX2O60749 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX2O60749 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX2O60749 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX2O60749 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX2O60749 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNX2O60749 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX2O60749 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX2O60749 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX2O60749 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX2O60749 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX2O60749 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX2O60749 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX2O60749 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms