Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN34H7C241 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN34H7C241 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLDN34H7C241 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLDN34H7C241 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN34H7C241 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN34H7C241 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN34H7C241 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN34H7C241 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN34H7C241 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN34H7C241 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN34H7C241 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN34H7C241 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN34H7C241 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN34H7C241 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN34H7C241 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN34H7C241 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLDN34H7C241 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN34H7C241 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLDN34H7C241 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLDN34H7C241 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN34H7C241 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN34H7C241 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN34H7C241 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN34H7C241 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN34H7C241 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN34H7C241 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN34H7C241 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms