Protein–RNA interactions for Protein: E5RJ46

C8orf87, Uncharacterized protein C8orf87, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf87E5RJ46 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C8orf87E5RJ46 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf87E5RJ46 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C8orf87E5RJ46 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf87E5RJ46 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf87E5RJ46 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf87E5RJ46 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C8orf87E5RJ46 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C8orf87E5RJ46 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C8orf87E5RJ46 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C8orf87E5RJ46 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C8orf87E5RJ46 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C8orf87E5RJ46 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C8orf87E5RJ46 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
C8orf87E5RJ46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf87E5RJ46 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms