Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA8B8ZZ34 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA8B8ZZ34 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHISA8B8ZZ34 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHISA8B8ZZ34 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHISA8B8ZZ34 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHISA8B8ZZ34 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA8B8ZZ34 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA8B8ZZ34 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SHISA8B8ZZ34 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SHISA8B8ZZ34 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SHISA8B8ZZ34 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SHISA8B8ZZ34 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA8B8ZZ34 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SHISA8B8ZZ34 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SHISA8B8ZZ34 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SHISA8B8ZZ34 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA8B8ZZ34 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHISA8B8ZZ34 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SHISA8B8ZZ34 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SHISA8B8ZZ34 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SHISA8B8ZZ34 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SHISA8B8ZZ34 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SHISA8B8ZZ34 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SHISA8B8ZZ34 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA8B8ZZ34 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SHISA8B8ZZ34 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA8B8ZZ34 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SHISA8B8ZZ34 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SHISA8B8ZZ34 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189 ms