Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LINC00587B1AMM8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LINC00587B1AMM8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LINC00587B1AMM8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00587B1AMM8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00587B1AMM8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00587B1AMM8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00587B1AMM8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LINC00587B1AMM8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LINC00587B1AMM8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LINC00587B1AMM8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00587B1AMM8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00587B1AMM8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00587B1AMM8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LINC00587B1AMM8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LINC00587B1AMM8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LINC00587B1AMM8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LINC00587B1AMM8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LINC00587B1AMM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00587B1AMM8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00587B1AMM8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms