Protein–RNA interactions for Protein: A6NKN8

PCP4L1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4L1A6NKN8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCP4L1A6NKN8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCP4L1A6NKN8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCP4L1A6NKN8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCP4L1A6NKN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCP4L1A6NKN8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCP4L1A6NKN8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCP4L1A6NKN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCP4L1A6NKN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCP4L1A6NKN8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCP4L1A6NKN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCP4L1A6NKN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCP4L1A6NKN8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCP4L1A6NKN8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCP4L1A6NKN8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCP4L1A6NKN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCP4L1A6NKN8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCP4L1A6NKN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCP4L1A6NKN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCP4L1A6NKN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCP4L1A6NKN8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCP4L1A6NKN8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCP4L1A6NKN8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCP4L1A6NKN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCP4L1A6NKN8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCP4L1A6NKN8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCP4L1A6NKN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCP4L1A6NKN8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCP4L1A6NKN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCP4L1A6NKN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCP4L1A6NKN8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCP4L1A6NKN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCP4L1A6NKN8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCP4L1A6NKN8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PCP4L1A6NKN8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PCP4L1A6NKN8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PCP4L1A6NKN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PCP4L1A6NKN8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PCP4L1A6NKN8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCP4L1A6NKN8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PCP4L1A6NKN8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PCP4L1A6NKN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PCP4L1A6NKN8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms