Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KLHL33A6NCF5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KLHL33A6NCF5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KLHL33A6NCF5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KLHL33A6NCF5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KLHL33A6NCF5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL33A6NCF5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL33A6NCF5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KLHL33A6NCF5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KLHL33A6NCF5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KLHL33A6NCF5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KLHL33A6NCF5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KLHL33A6NCF5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KLHL33A6NCF5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KLHL33A6NCF5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KLHL33A6NCF5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KLHL33A6NCF5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KLHL33A6NCF5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL33A6NCF5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KLHL33A6NCF5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHL33A6NCF5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHL33A6NCF5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KLHL33A6NCF5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KLHL33A6NCF5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KLHL33A6NCF5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KLHL33A6NCF5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL33A6NCF5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KLHL33A6NCF5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KLHL33A6NCF5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KLHL33A6NCF5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms