Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRBV10-2A0A0K0K1G8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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