Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
APOBEC3GQ9HC16 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
APOBEC3GQ9HC16 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms