Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00526Q96FQ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00526Q96FQ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00526Q96FQ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms