Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT2Q8N9I0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYT2Q8N9I0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT2Q8N9I0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT2Q8N9I0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms