Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC171Q6TFL3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC171Q6TFL3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC171Q6TFL3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC171Q6TFL3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms