Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMD4P55036 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMD4P55036 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms