Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.521e-11■■■■■ 42.2
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SUB1P53999 ACTR10-204ENST00000554402 1544 ntTSL 1 (best)14.91□□□□□ -0.024e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 ACTR10-207ENST00000555229 1517 ntTSL 514.28□□□□□ -0.124e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 ACTR10-205ENST00000554642 687 ntTSL 35.11□□□□□ -1.594e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 ACTR10-203ENST00000553907 780 ntTSL 34.23□□□□□ -1.734e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 ACTR10-216ENST00000557711 1584 ntTSL 1 (best)3.48□□□□□ -1.854e-9■■■■■ 42.2
SUB1P53999 RPL34-206ENST00000504231 629 ntTSL 1 (best)5.5□□□□□ -1.531e-18■■■■■ 42
SUB1P53999 COPB2-201ENST00000333188 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 42
SUB1P53999 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.713e-11■■■■■ 42
SUB1P53999 COPB2-203ENST00000503326 433 ntTSL 32.78□□□□□ -1.963e-11■■■■■ 42
SUB1P53999 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-218ENST00000636639 2125 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 41.9
SUB1P53999 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 41.9
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SUB1P53999 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 41.9
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SUB1P53999 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 41.7
SUB1P53999 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 41.7
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SUB1P53999 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.385e-59■■■■■ 41.6
SUB1P53999 HMGN1-216ENST00000486741 4299 ntTSL 211.16□□□□□ -0.625e-59■■■■■ 41.6
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SUB1P53999 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 41.5
SUB1P53999 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.097e-7■■■■■ 41.5
SUB1P53999 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.137e-7■■■■■ 41.5
SUB1P53999 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.869e-9■■■■■ 41.4
SUB1P53999 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.689e-9■■■■■ 41.4
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SUB1P53999 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.099e-9■■■■■ 41.4
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SUB1P53999 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-16■■■■■ 41.4
SUB1P53999 PDXDC1-203ENST00000450288 4171 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.339e-9■■■■■ 41.4
SUB1P53999 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-16■■■■■ 41.4
SUB1P53999 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 23.03□□□□□ -1.929e-9■■■■■ 41.4
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SUB1P53999 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 41.4
SUB1P53999 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.575e-9■■■■■ 41.4
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SUB1P53999 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 41.3
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SUB1P53999 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.651e-88■■■■■ 41.2
SUB1P53999 RPL17-219ENST00000584364 523 ntTSL 23.61□□□□□ -1.831e-88■■■■■ 41.2
SUB1P53999 KPNB1-212ENST00000582126 653 ntTSL 511.17□□□□□ -0.628e-11■■■■■ 41.2
SUB1P53999 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 LSM2-214ENST00000493387 767 ntTSL 59.07□□□□□ -0.965e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 LSM2-212ENST00000477182 767 ntTSL 38.94□□□□□ -0.985e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 LSM2-209ENST00000470083 641 ntTSL 28.23□□□□□ -1.095e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 LSM2-213ENST00000491421 820 ntTSL 36.13□□□□□ -1.435e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 LSM2-210ENST00000470086 713 ntTSL 25.29□□□□□ -1.565e-9■■■■■ 41.1
SUB1P53999 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.265e-7■■■■■ 41
SUB1P53999 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 26.84□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 41
SUB1P53999 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 25.26□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 41
SUB1P53999 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 23.07□□□□□ -1.925e-7■■■■■ 41
SUB1P53999 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.13e-10■■■■■ 40.9
SUB1P53999 CSNK2A2-205ENST00000566813 1569 ntTSL 56.55□□□□□ -1.363e-10■■■■■ 40.9
SUB1P53999 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-48■■■■■ 40.9
SUB1P53999 UBB-209ENST00000614404 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.063e-48■■■■■ 40.9
SUB1P53999 UBB-202ENST00000395837 1014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.273e-48■■■■■ 40.9
SUB1P53999 UBB-208ENST00000578706 500 ntTSL 34.82□□□□□ -1.643e-48■■■■■ 40.9
SUB1P53999 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.265e-9■■■■■ 40.9
SUB1P53999 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 40.8
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