Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT16P08779 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT16P08779 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT16P08779 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT16P08779 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT16P08779 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT16P08779 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT16P08779 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT16P08779 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT16P08779 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT16P08779 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT16P08779 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT16P08779 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT16P08779 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT16P08779 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT16P08779 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT16P08779 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT16P08779 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT16P08779 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT16P08779 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT16P08779 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT16P08779 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT16P08779 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT16P08779 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT16P08779 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT16P08779 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT16P08779 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms