Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
APAF1O14727 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
APAF1O14727 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
APAF1O14727 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
APAF1O14727 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
APAF1O14727 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
APAF1O14727 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
APAF1O14727 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
APAF1O14727 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
APAF1O14727 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APAF1O14727 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APAF1O14727 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APAF1O14727 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
APAF1O14727 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
APAF1O14727 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
APAF1O14727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
APAF1O14727 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
APAF1O14727 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
APAF1O14727 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APAF1O14727 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
APAF1O14727 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
APAF1O14727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APAF1O14727 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
APAF1O14727 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APAF1O14727 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APAF1O14727 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APAF1O14727 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
APAF1O14727 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
APAF1O14727 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
APAF1O14727 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APAF1O14727 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
APAF1O14727 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
APAF1O14727 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
APAF1O14727 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
APAF1O14727 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
APAF1O14727 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APAF1O14727 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APAF1O14727 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APAF1O14727 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
APAF1O14727 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
APAF1O14727 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
APAF1O14727 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
APAF1O14727 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
APAF1O14727 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APAF1O14727 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
APAF1O14727 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
APAF1O14727 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
APAF1O14727 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
APAF1O14727 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APAF1O14727 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
APAF1O14727 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms